在知网查重系统中，词语顺序的改变会直接影响查重结果。词语顺序改变后，原本相似度较高的文本可能被误判为不相似，导致查重结果不准确。因此，在使用知网查重工具时，应尽量保持原文词语的顺序，以确保查重结果的准确性。

另外，词语顺序的改变也可能导致一些本来不相似的文本被错判为相似。这种情况下，可能会给学术论文等领域带来误解和困扰。因此，在进行文本查重时，除了注意词语的相似度外，还要注意词语的顺序，避免因词语顺序改变而造成的查重错误。